L'objet thématique Système, Analyse, Modélisation et Informatique vise à développer des méthodes et des outils dans les domaines de l'instrumentation, des mathématiques appliquées et de l'informatique. Ses principales activités s'articulent autour de la modélisation, l’évaluation, les systèmes d'information, le calcul scientifique, l'instrumentation et le contrôle des écosystèmes microbiens et des bioprocédés.